Лесная кабарга (Moschus berezovskii) находится под угрозой исчезновения, а проблемы с пищеварением серьезно осложняют разведение этого редкого вида в неволе. Новое исследование, опубликованное в Frontiers in Veterinary Science, раскрывает, как содержание в неволе кардинально меняет микробиом кишечника у этих животных.
Дикая природа против искусственной среды
Исследователи проанализировали образцы фекалий лесных кабарг из трех групп: диких животных из заповедника Баотяньман (провинция Хэнань), а также содержащихся в неволе особей из Наньяна (Хэнань) и Гаопина (Шаньси). Для анализа микробного сообщества использовали высокопроизводительное секвенирование 16S рРНК.
Результаты оказались впечатляющими: хотя доминирующие типы бактерий (Firmicutes, Bacteroidota и Proteobacteria) присутствовали во всех группах, их соотношение существенно различалось. У диких кабарг содержание Actinobacteriota составило 11,13%, что значительно превышало показатели содержащихся в неволе животных (1,29% в Хэнане и 6,12% в Шаньси).
Функциональные различия микробиома
Особенно интересными оказались функциональные различия бактериальных сообществ. Согласно данным авторов, микробиом диких кабарг был значительно обогащен путями биодеградации ксенобиотиков и метаболизма липидов. Это указывает на адаптацию к разнообразному растительному рациону в естественной среде.
В противоположность этому, у содержащихся в неволе животных преобладали пути трансляции и нуклеотидного метаболизма, что может отражать адаптацию к более однообразному искусственному рациону.
Авторы исследования выявили 36 дифференциальных биомаркеров между группами. У диких кабарг были обогащены роды Bacillus, Arthrobacter и Microbacterium, тогда как у содержащихся в неволе преобладали Bacteroides, Clostridium и Eubacterium.
Интересно, что некоторые особи из группы Шаньси по составу микробиома оказались ближе к диким животным, что может указывать на влияние географических факторов или условий содержания.
По мнению исследователей, полученные данные могут служить теоретической основой для улучшения здорового разведения содержащихся в неволе популяций и эталоном для оценки состояния здоровья диких популяций. Понимание этих различий критически важно для программ сохранения этого исчезающего вида.