Азиатская дрофа-красотка — уязвимый вид птиц, который находится под защитой международных программ разведения в неволе. Но теперь эти редкие птицы столкнулись с новой угрозой: мультирезистентными патогенами, которые «перепрыгивают» из промышленного птицеводства.
Исследователи из Объединенных Арабских Эмиратов опубликовали в Frontiers in Veterinary Science тревожные данные о том, как опасная Salmonella Kentucky ST198 с геном устойчивости к колистину mcr-1.1 попала от бройлерных кур к содержащейся в неволе дрофе-красотке.
Когда геномный анализ раскрывает «криминальные связи»
В ходе посмертного бактериологического исследования желточного мешка погибшей азиатской дрофы-красотки авторы выделили изолят Salmonella Kentucky FAZ18016. То, что обнаружил полногеномный анализ, превзошло самые худшие опасения.
Изолят продемонстрировал фенотипическую устойчивость к 17 антимикробным препаратам, поддерживаемую 21 геномным детерминантом резистентности, включая blaTEM-1, mph(A), tet(A), floR, sul1/sul3 и mcr-1.1. Минимальная ингибирующая концентрация колистина составила 8 мг/л — критический уровень резистентности.
Особенно тревожным оказалось расположение гена mcr-1.1 на плазмиде IncHI2, которая также несла tet(A), terC и множественные инсерционные последовательности. Авторы обнаружили, что эта плазмида имеет более 99% идентичности нуклеотидной последовательности с плазмидами, описанными у Klebsiella pneumoniae и Escherichia coli.
Генетические «отпечатки пальцев» указывают на источник
Исследователи идентифицировали у изолята 156 генов, ассоциированных с вирулентностью, включая полные острова патогенности Salmonella 1 и 2, системы секреции III и VI типов. Но самым важным открытием стал филогеномный анализ.
Анализ полиморфизмов ядерного генома отнес FAZ18016 к секвенс-типу ST198 и выявил 31-166 SNP-различий от ранее охарактеризованных изолятов от бройлеров в ОАЭ. Наиболее близкородственные штаммы отличались всего на 31-33 SNP, что, по мнению авторов, свидетельствует об относительно недавнем общем происхождении.
Эти данные указывают на потенциальное «переливание» высокорискового клона S. Kentucky ST198, несущего mcr-1.1, из птицеводства в популяции диких животных в неволе. Исследователи подчеркивают необходимость интегрированного геномного надзора за антимикробной резистентностью и усиления биобезопасности на границе между дикой природой и птицеводством в рамках концепции «Единое здоровье».
Открытие демонстрирует, как промышленное животноводство может становиться резервуаром опасных резистентных патогенов, которые впоследствии угрожают уязвимым видам диких животных. Это особенно критично для программ сохранения, где каждая особь на счету.