Pasteurella multocida остается одним из наиболее важных зоонозных патогенов, способным поражать широкий спектр домашних и диких животных. Несмотря на накопленные геномные данные по изолятам от сельскохозяйственных животных, штаммы от дикой фауны до сих пор изучены недостаточно.
Исследователи из Коннектикута провели полногеномное секвенирование девяти изолятов P. multocida, полученных в 2022-2023 годах от коров, оленя, кролика, кошки и фазана. Цель работы — охарактеризовать генетические особенности патогена и углубить понимание его хост-ассоциированного разнообразия.
Неожиданные генетические паттерны
По данным авторов, все изоляты, за исключением кошачьего штамма, имели общий генотип across множественных видов хозяев. Эти штаммы классифицировались как капсульный тип A и LPS тип L3. В отличие от них, изолят от кошки не имел определяемого капсульного локуса и был отнесен к LPS типу L1.
Особенно интересными оказались данные по антимикробной резистентности. Согласно публикации в Frontiers in Veterinary Science, бычьи изоляты демонстрировали значительно более высокую устойчивость к антимикробным препаратам, включая единственный мультирезистентный штамм. Именно эти изоляты эксклюзивно содержали гены резистентности: aph(3′)-Ia, aph(6)-Id, sul2 и tet(H).
В то же время изоляты от небычьих хозяев показали низкую резистентность и отсутствие детектируемых детерминант устойчивости.
Филогенетические сюрпризы
Мультилокусное секвенирование выявило, что все бычьи изоляты принадлежали к ST1 (Multi-Host схема) и ST79 (RIRDC схема). Однако изоляты от других животных продемонстрировали гораздо большее генетическое разнообразие, включая пять новых типов последовательностей.
Гены вирулентности оказались в значительной степени консервативными у всех хозяев, что указывает на стабильность патогенного потенциала P. multocida.
Филогенетический анализ на основе SNP core-генома показал преимущественно хост-ассоциированную кластеризацию. Авторы исследования отметили, что бычьи изоляты группировались с бычьими линиями из других стран, в то время как небычьи изоляты кластеризовались с генетически разнообразными международными линиями, включая птичьи и человек-ассоциированные штаммы.
Эти результаты подчеркивают важность интегрированного фенотипического и геномного надзора за P. multocida у различных видов животных. Выявленные хост-связанные паттерны в антимикробной резистентности и геномном разнообразии могут иметь критическое значение для разработки стратегий контроля и лечения инфекций, вызванных этим патогеном.