Овцы породы дуоланг, разводимые в Синьцзяне для получения мяса и жира, представляют значительный интерес для селекционеров. Однако генетические механизмы, определяющие размеры тела у этой породы, до недавнего времени оставались неизученными.
Исследователи из Китая провели масштабный геномный анализ, чтобы раскрыть секреты генетической архитектуры, отвечающей за телосложение овец дуоланг. Результаты их работы, опубликованные в Frontiers in Veterinary Science, могут кардинально изменить подходы к селекции этой породы.
Революция в геномной селекции овец
Авторы выполнили полногеномное секвенирование 224 овец дуоланг с полными данными по шести морфометрическим показателям: росту, длине тела, обхвату груди, ширине плеч и ширине бедер. После строгого контроля качества и фильтрации данных исследователи получили 19,65 миллиона высококачественных SNP (однонуклеотидных полиморфизмов).
Для полногеномного поиска ассоциаций (GWAS) авторы использовали 2,1 миллиона относительно независимых SNP в смешанной линейной модели GEMMA. Дополнительно был проведен анализ сигналов селекции с использованием статистики Tajima's D и интегрированных гаплотипных оценок на выборке из 60 животных.
Результаты превзошли ожидания: 24 значимых SNP были ассоциированы с ростом, длиной тела, обхватом груди, шириной плеч и бедер. Интеграция данных GWAS с регионами селекционных сигналов позволила приоритизировать 31 ген-кандидат.
Ключевые гены размеров тела
Среди наиболее перспективных генов-кандидатов авторы выделили:
CA10 — ген карбоангидразы, потенциально влияющий на метаболические процессы роста
WDR45B — участвует в регуляции клеточного цикла и может влиять на развитие тканей
FADS2 — ключевой фермент синтеза жирных кислот, важный для мясо-жировой продуктивности
LGALS12 и CTNNA2 — гены, связанные с клеточной адгезией и развитием тканей
Исследователи использовали данные SheepGTEx для характеристики паттернов экспрессии генов в различных тканях, что предоставило функциональный контекст для приоритизированных генов.
По данным авторов, эти находки открывают новые перспективы для понимания генетической архитектуры морфометрических признаков у овец дуоланг. Идентифицированные локусы-кандидаты требуют дальнейшей валидации, но уже сейчас могут стать основой для разработки более эффективных программ генетического улучшения породы.
Согласно публикации, полученные результаты демонстрируют потенциал полногеномных подходов для селекции овец и могут быть адаптированы для других пород мясо-молочного направления продуктивности.