Ключевые результаты
- BuCoV был обнаружен исключительно в Шэньчжэне с показателем распространенности 1,78% (3/168)
- Все положительные образцы получены от птиц рода Бюльбюль (Pycnonotus spp.)
- Штамм GD2411 показал высокую нуклеотидную идентичность (97,26%) со штаммами HKU11-796 и HKU11-934
- Выявлена значительно более низкая схожесть (78,9%-82,4%) с другими дельта-коронавирусами
- Обнаружено 31 замещение аминокислот в S-белке и мутации в RdRp, 3CLpro и нуклеокапсидном белке
Методология
Сбор и скрининг образцов
- В период 2023-2024 гг. проведено молекулярное наблюдение в 12 регионах провинции Гуандун
- Собрано и проанализировано 2145 образцов фекалий диких птиц
- Для обнаружения BuCoV использовали количественную ПЦР в реальном времени
Геномное секвенирование и анализ
- Полные геномы репрезентативных штаммов получены методом секвенирования нового поколения
- Филогенетическая реконструкция проведена с использованием методов максимального правдоподобия
- Для выявления рекомбинаций применялись программы RDP4 и SimPlot
- Выполнен сравнительный анализ аминокислотных последовательностей
Клиническое значение
Эволюция вируса и риски
- Анализ показывает, что BuCoV GD2411 возник в результате межлинейной рекомбинации
- Вирус находится в процессе адаптивной эволюции, особенно в области S-белка
- Обнаружение BuCoV исключительно в Шэньчжэне, который является важным узлом Восточноазиатско-Австралазийского пролетного пути, позволяет предположить роль мигрирующих птиц в распространении вируса
Мутации и их потенциальное влияние
- Идентифицированные мутации могут влиять на репликацию вируса, адаптацию к хозяину и уклонение от иммунного ответа
- Мозаичная структура гена S указывает на участие множественных линий коронавирусов в рекомбинации
Выводы
- BuCoV имеет ограниченное распространение среди диких птиц в провинции Гуандун, с положительными образцами только в Шэньчжэне
- Выявлены признаки активной эволюции вируса через рекомбинацию и адаптивные мутации
- Полученные данные создают основу для понимания разнообразия BuCoV и оценки потенциальных зоонозных рисков в южном Китае
- Необходим дальнейший мониторинг для отслеживания эволюции вируса и его распространения в популяциях диких птиц