Эпидемическая диарея свиней (PEDV) продолжает эволюционировать, создавая серьезную угрозу для свиноводческой отрасли во всем мире. Мониторинг появления новых вариантов этого вируса становится критически важной задачей для ветеринарных эпидемиологов. Недавнее исследование, опубликованное в Frontiers in Veterinary Science, привлекло внимание специалистов, обнаружив на территории Кореи принципиально новый штамм PEDV, отличающийся от доминировавших ранее вариантов и связанный с высоковирулентными китайскими штаммами.
Новый игрок на эпидемиологическом поле
С 2013 года в Корее преобладали штаммы PEDV генотипа 2b (G2b). Однако исследователи выявили вирусные изоляты, существенно отличающиеся от этих ранее циркулировавших вариантов. Находка произошла на двух свиноводческих фермах, где наблюдались случаи тяжелой диареи с высокой смертностью среди поросят-сосунов.
Ученым удалось выделить и детально охарактеризовать новый штамм, получивший обозначение KPED2021-1. Генетический анализ показал, что на уровне полного генома KPED2021-1 демонстрирует более 99% гомологии с китайскими штаммами PEDV подтипа G2c, которые характеризуются значительной генетической вариабельностью в Китае. При этом с корейскими и другими международными штаммами PEDV новый изолят имел лишь 96.6%-98.7% гомологии.
Особенно интересно, что KPED2021-1 показал повышенную нуклеотидную дивергенцию в генах NSP1, ORF3 и N по сравнению с корейскими и другими глобальными штаммами PEDV. В этих регионах геном нового изолята был генетически ближе к китайским штаммам подтипа G2c.
Молекулярные особенности и клиническая значимость
При сравнении аминокислотной последовательности S-белка (spike protein) штамма KPED2021-1 с S-белками корейских штаммов G2b было выявлено 27 аминокислотных замен и уникальная делеция в положении 11197. Эти изменения могут иметь критическое значение для вирулентности, так как S-белок играет ключевую роль в прикреплении вируса к клеткам хозяина и проникновении в них.
Для подтверждения патогенности нового штамма исследователи провели экспериментальное заражение поросят-сосунов. Результаты оказались тревожными: инфицированные животные продемонстрировали тяжелые клинические симптомы и выраженные гистопатологические изменения. Наиболее важным показателем высокой вирулентности стала 100% смертность среди экспериментально зараженных поросят.
Данная работа представляет собой первое сообщение о появлении в Корее PEDV подтипа G2c, генетически близкого к китайским вариантам. Выделенный штамм может служить важным референсным образцом для дальнейшей разработки вакцин и исследований перекрестной защиты.
Учитывая высокую патогенность нового изолята и его генетические отличия от ранее циркулировавших штаммов, необходим усиленный эпидемиологический мониторинг и пересмотр существующих стратегий вакцинации против PEDV в регионе. Эволюция вируса эпидемической диареи свиней в очередной раз демонстрирует необходимость постоянного совершенствования диагностических и профилактических подходов в ветеринарной медицине.